무선공인인증서란 휴대폰이나 개인휴대단말기(PDA) 등과 같은 연산처리능력이 낮은 단말에서 공인인증서 기반 전자서명을 사용할 수 있도록 최적화해 발급한 것이다. 무선공인인증서는 유선공인인증서를 통한 신원확인 후 등록이 완료되면 등록할 때 받은 참조번호와 인가코드를 사용해 무선단말에서 인증서 발급신청을 수행하는 방법으로 발급이 이뤄진다. 금융결제원·한국정보인증·코스콤(옛 한국증권전산) 등 공인인증기관에서 발급받을 수 있다.
무선공인인증서는 무선단말을 이용한 전자거래에서 전자서명과 사용자 인증서비스 등에 활용할 수 있다. 무선공인인증서를 통해 모바일 뱅킹과 신용카드 거래 등 각종 전자 거래의 안전성을 높이는 것은 물론이고 주민등록번호를 대체해 미성년자 인증 등을 수행할 수 있다.
무선공인인증서도 유선공인인증서와 마찬가지로 사이버 인감 역할을 한다. 각종 무선전자거래시 공인인증서를 사용하면 신원확인, 문서의 위·변조, 거래사실의 부인 방지 등의 효과를 얻을 수 있다.